Вид документа : Статья из журнала Шифр издания : Автор(ы) : Микрюков В. С., Дуля О. В., Лиходеевский Г. А., Воробейчик Е. Л. Заглавие : Анализ экологических сетей многокомпонентных сообществ микроорганизмов: возможности, ограничения, потенциальные ошибки Место публикации : Экология. - 2021. - № 3. - С.179-192: 4 рис., 3 табл. - ISSN 0367-0597. - ISSN 0367-0597 Примечания : Библиогр.: с. 189-192 (97 назв.) УДК : 574 ББК : 28.08 Предметные рубрики: Биология Прикладная биология Ключевые слова (''Своб.индексиров.''): алгоритмы построения сетей--анализы сетей--биотические взаимоотношения--биотическое сообщество--метабаркодирование--микроорганизмы--многокомпонентные сообщества микроорганизмов--потенциальные ошибки--секвенирование днк--топология сетей--экологические ниши--экологические сети Аннотация: Благодаря высокой разрешающей способности и производительности секвенирования ДНК исследователям открывается высокое разнообразие сообществ бактерий, грибов, протистов и микробеспозвоночных почвы, древесины, филлосферы и других природных сред. Для изучения свойств таких сообществ необходимы мощные инструменты анализа многокомпонентных систем. Один из них – анализ экологических сетей, позволяющий решить широкий круг задач экологии. В обзоре кратко описаны возможности анализа сетей, его базовые понятия и метрики топологии сетей. Указаны ограничения, связанные с особенностями секвенирования ДНК (композиционность и разреженность данных), а также потенциальные источники ошибок при интерпретации результатов (реликтовая ДНК, артефактные последовательности ДНК, артефактные связи). Основное внимание уделено сообществам микроорганизмов, но обсуждаемые вопросы релевантны большинству других групп биоты. Доп.точки доступа: Микрюков, В. С.; Дуля, О. В.; Лиходеевский, Г. А.; Воробейчик, Е. Л. |